Arrhenia obatra est un champignon bryophile et muscicole. Il pousse de manière solitaire ou en petits groupes principalement à l'automne dans les milieux humides, sur sols pauvres ou sableux, parmi les mousses et hépatiques (notamment en zones subalpines, tourbières ou pelouses maigres).
Non comestible. En raison de sa très petite taille et de sa rareté, il n'a aucun intérêt culinaire.